利用Shotgun蛋白质组学进行膜蛋白鉴定
膜蛋白(membrane proteins)广泛分布于细胞内外膜系统,在信号转导、物质运输、细胞识别等过程中发挥关键作用。尽管膜蛋白仅占人类基因组编码蛋白的约30%,却是药物作用靶点的60%以上。然而,由于其疏水性强、易聚集、提取困难等特点,膜蛋白始终是蛋白质组学研究中的“硬骨头&rdq
Activity-Based Protein Profiling实验流程及操作要点
Activity-Based Protein Profiling(ABPP)实验流程涉及从探针设计、样本处理,到信号检测和数据分析的多个关键步骤。以下是标准ABPP实验流程及每一步的操作要点,适用于大多数酶类研究(如丝氨酸酯酶、蛋白酶、脱酰化酶等)。 一、ABPP实验流程概览 1、活性探针准备 2
什么是ABPP?它为何正在颠覆功能蛋白组学?
一、什么是ABPP? ABPP(Activity-Based Protein Profiling,活性基础蛋白质谱分析)是基于化学探针的蛋白质组学技术,专门用于检测酶类蛋白的“活性状态”,而非仅仅关注其表达水平。ABPP使用活性探针(Activity-Based Probes
从样本到结果:鸟枪蛋白质组学技术全流程解析
鸟枪法蛋白质组学(Shotgun Proteomics)是当前蛋白质组研究中应用最广泛的策略之一。它通过将复杂蛋白混合物酶解成肽段,并结合液相色谱-质谱联用技术(LC-MS/MS)实现大规模蛋白质鉴定与定量,广泛用于疾病机制解析、生物标志物筛选及功能蛋白研究。本文系统梳理鸟枪蛋白质组学从样本处理到数
鸟枪法蛋白质组学在生物标志物发现中的应用
生物标志物是实现早期诊断、疾病分型和个体化治疗的关键工具。随着质谱技术的快速演进,蛋白质组学已成为标志物发现的重要手段。其中,鸟枪法蛋白质组学(shotgun proteomics)因其高通量、无偏倚、覆盖广等优势,在复杂样本的标志物筛选中展现出巨大潜力。 一、鸟枪法蛋白质组学概述 ※ 技术原理
鸟枪法蛋白质鉴定常用的数据采集模式:DDA详解
在蛋白质组学中,鸟枪法(Shotgun Proteomics)依托高通量质谱分析技术,成为主流的全蛋白质组定性手段。其中,数据依赖采集(Data-Dependent Acquisition, DDA)是最早被广泛采用的采集模式,至今仍在新蛋白鉴定和探索性研究中发挥核心作用。本文将系统解析DDA的工作
